İlk uzun metrajlı filmi, efsanevi Çek aktris Lída Baarová'nın kız kardeşi Zorka Janů'nın başrol oynadığı, 1938 yapımı Cech panen Kutnohorských'ti . Janů ayrıca Vávra'nın Fraud filmlerinde Rubens ve Pacientka Dr. Hegela , her ikisi de 1940'tan. Baarová, Vávra'nın Virginity (1937), Masked Lover (1939), Girl in Blue (1939) ve Turbína (1941) filmlerinde rol aldı .
Komünistlerin 1948'de iktidara gelmesinin ardından Vávra, yeni siyasi ortama hızla uyum sağladı ve mevcut rejimi öven ve geçmişin yeni, resmi yorumunu destekleyen filmler üretti.
1950'lerde Jan Hus (1954), Jan Žižka (1955) ve Proti všem'den ( Her Şeye Karşı , 1957) oluşan, en ünlü eserlerinden biri olan "Hussite Üçlemesi"ni üretti.
1950'lerde Otakar Vávra, bir grup Çek yönetmen arkadaşıyla birlikte Prag'da Sahne Sanatları Akademisi Film Fakültesi'ni (FAMU) kurdu ve burada elli yılı aşkın bir süre öğretmenlik yaptı. Öğrencileri arasında Miloš Forman, Jiří Menzel, Věra Chytilová ve Emir Kusturica'nın da aralarında bulunduğu 1960'ların Çekoslovak Yeni Dalgası'nın birkaç yönetmeni vardı.
Hükümet 1960'larda daha liberal hale gelince, Vávra'nın sineması en üretken dönemine girdi; Zlatá reneta (1965), Kladivo na čarodějnice (1969) ve daha sonra Komediant'ı (1984) yönetti. Vávra'nın en beğenilen eseri Romance pro křídlovku (1966), Çek lirik şairi František Hrubín'in bir şiirine dayanan siyah beyaz bir filmdir ve farklı geçmişlere sahip iki genç aşık arasındaki talihsiz bir yaz aşkını konu alır.
Komünistler 1989'da iktidardan düştüğünde, film endüstrisine verilen devlet sübvansiyonları kesildi ve Vávra'nın Evropa tančila valčík adlı tarihi destan planlarının küçültülmesi gerekti.
Elli iki uzun metrajlı film yönetti.