Eliseo Subiela'nın sinemasının temel temaları arasında şunlar bulunmaktadır:
Aşk ve İlişkiler: Subiela'nın filmleri, bireylerin aşkı ve ilişkileri üzerindeki derinlikli sorgulamalarıyla doludur. Genellikle romantik ilişkilerin karmaşıklığını ve insan ruhunun dinamiklerini işler.
Hayatın Anlamı: Filmlerinde insanın varoluşsal sorgulamaları, yaşamın anlamı ve bireyin kendi kimliğini bulma çabası sıkça karşımıza çıkar.
Ruhsal Derinlik: Subiela'nın yapıtları, insan ruhunun karmaşık yapısını ve bireylerin içsel mücadelelerini keşfeder. Kendine dönüş, içsel huzur arayışı gibi temalar öne çıkar.
Gerçek ve Hayal: Filmlerinde gerçek ile hayal arasındaki ince çizgiyi sorgulayan anlatımlar yer alır. Bu tema, karakterlerin gerçeklik algılarını ve yaşamlarını etkileyen içsel çatışmalarını yansıtır.
Bireysellik ve Toplumsal Eleştiri: Subiela'nın eserlerinde bireyin toplumsal baskılara karşı duruşu ve bireysel özgürlük arayışı sıklıkla işlenir.
Bu temalar, Subiela'nın kendine özgü üslubu ve derin anlatım tarzı ile birleşerek etkileyici ve düşündürücü filmler oluşturur.