29 Temmuz 1921’de Neuilly-sur-Seine’de doğdu. Asıl adı Christian François Bouche-Villeneuve’dir. Kendisi, çocukluğu ve gençliği üzerine kesin bilgi vermemektedir. Direniş hareketi içinde yer aldığı II.Dünya Savaşı’ndan sonra Esprit dergisinin yazı kadrosuna girdi. Derginin film eleştirisi köşesini Andre Bazin’le paylaştı, ayrıca şiirler, kısa öyküler, müzik üzerine yazılar ve siyasal yorumlar yazdı. Yazılarıyla Cahiers du Cinema dergisine katkıda bulundu. Çeşitli ülkeleri gezip fotoğraf çekerek, her cildini bir ülkeyle ilgili izlenimlerine ayırdığı bir dizi kitap yayımladı. 1952’de Helsinki’ye giderek, Olympia 52 adlı ilk filmini çekti.
Alain Resnais ile birlikte çektiği, Fransız sömürgeciliğini eleştiren Les statues meurent aussi (“Heykeller de Ölür”) filminin gösterimi uzun bir süre engellendi. 1955’te Çin’deki yeni toplumsal düzeni görüntüleyen Dimanche a Pekin’i (“Pekin’de Pazar”), 1961’de Küba’ya giderek devrimin ikinci yıldönümü için Cuba si! filmlerini çekti. Cuba si!’nin kurgu işlemi sırasında, ABD, Fidel Castro’yu devirmek için Domuzlar Körfezi çıkarmasına girişince, Marker, filmine Amerikan karşıtı bir bölüm ekledi ve film Fransız yetkililerince yasaklandı. 1963’te, fotoğraflardan oluşan ve bilim kurgu özellikleri taşıyan şiirsel yapıtı La jetee ile Jean Vigo Ödülü’nü kazandı. 1967’de SLON (Societe pour le Lancement des Oeuvres Nouvelles-Yeni Yapıtları Tanıtma Topluluğu) adlı topluluğu kurdu. Godard, Ivens, William Klein (1926), Lelouch ve Resnais gibi yönetmenleri bir araya getiren bu toplulukça önce yapımcılığını ve kurgusunu Marker’in üstlendiği Loin du Vietnam (“Vietnam’dan Uzakta”), ardından daha başka siyasal içerikli filmler gerçekleştirildi.
Çeşitli kültürel kuruluşlar adına birçok ülkeye giderek belgesel filmler çeken Marker, bunların çoğunun metinlerini kendi yazmış, zaman zaman da bu açıklama metinlerini filmlerinden fotoğraflarla birlikte kitap olarak yayımlamıştır. Fransa’da belgesel sinemacılığın yeniden canlanmasını sağlamış, SLON bünyesinde kolektif filmciliğin gelişmesine öncülük etmiştir.